Kinetic Drive • HostCell

Kinetic Drive

Recurso interactivo para enseñar cómo se calculan los parámetros más usados para caracterizar un cultivo de células de mamífero, con foco en células CHO.

Sección 1 · Explicación

Fundamentos, fórmulas y ejemplo de cálculo

Esta sección está pensada para aprender de dónde salen los parámetros, cómo se calculan con datos discretos y cómo se interpretan en un cultivo CHO antes de pasar al simulador.

Qué hace esta página

Esta sección muestra cómo pasar de variables primarias medidas experimentalmente, como densidad celular viable, glucosa, lactato y producto, a parámetros derivados que suelen usarse para describir y comparar cultivos de células CHO. La lógica es siempre la misma: medir, integrar cuando hace falta, normalizar y después interpretar con cuidado qué significa cada parámetro.

Ejemplo guiado con un intervalo fijo de muestreo para no saturar la vista.

Curva de crecimiento e IVCD

El área sombreada corresponde al tramo de ejemplo usado para calcular la IVCD digital.

Sustratos y producto

Cuando pasas el cursor sobre cualquiera de las dos gráficas, la referencia temporal se sincroniza en ambas.

Tramo
Δt
μ
IVCDΔ
qGlc
qP

Cómo se calcula cada parámetro

En cada bloque se muestra primero una forma continua, que nace del balance o de la definición formal del parámetro, y después una forma discreta, que es la que realmente se usa al trabajar con datos digitales obtenidos por muestreo.

Versión continua + versión discreta
¿Qué es y cómo se calcula μ?
!
μ se calcula aquí por intervalo y no como una sola constante global. Esto es útil porque en cultivos CHO el crecimiento cambia con la fase del cultivo, la disponibilidad de nutrientes y la pérdida de viabilidad.

La velocidad específica de crecimiento describe qué tan rápido cambia la biomasa viable en términos relativos.

Forma continua

$$\frac{dX_v}{dt}=\mu X_v$$

Con datos discretos

$$\mu\approx\frac{\ln(X_{v,2})-\ln(X_{v,1})}{t_2-t_1}$$

IVCD: el puente entre concentración y célula
!
La IVCD es particularmente útil en cultivos de mamífero porque el proceso dura varios días y la biomasa viable cambia de manera importante durante la corrida. En sistemas microbianos rápidos, a menudo se trabaja más directamente con derivadas locales, fases exponenciales bien definidas o balances de sustrato más cerrados.

La IVCD integra la biomasa viable en el tiempo. Por eso sirve para normalizar consumos o producción y estimar cuánto hizo una célula promedio durante un tramo dado.

Forma continua

$$IVCD=\int X_v(t)\,dt$$

Con datos discretos

$$IVCD_{\Delta t}\approx\sum_i\left(\frac{X_{v,i}+X_{v,i+1}}{2}\right)(t_{i+1}-t_i)$$

Ejemplos de uso de IVCD/IVCC en cultivo de mamífero incluyen Oguchi et al. (2007), Mahé et al. (2021) y Schellenberg et al. (2022).

Consumo volumétrico y consumo específico
!
r y q no responden a la misma pregunta. r describe el cambio observado por volumen de cultivo; q intenta estimar el comportamiento medio por célula viable en el tramo analizado.

La tasa volumétrica de consumo indica cuánto cambia la concentración en el reactor. El consumo específico divide ese cambio entre la IVCD del tramo.

Forma continua

$$\frac{dS}{dt}=-r_S,\qquad \frac{dS}{dt}=-q_SX_v$$

Con datos discretos

$$r_{Glc}\approx\frac{Glc_1-Glc_2}{\Delta t},\qquad q_{Glc}\approx\frac{Glc_1-Glc_2}{IVCD_{\Delta t}}$$

Tasa de producción específica de producto
!
qP se interpreta mejor cuando el tramo elegido es fisiológicamente coherente. Si mezclas fases muy distintas en un solo cálculo, el valor promedio puede ocultar cambios importantes de productividad.

La producción específica intenta responder cuánto producto generó, en promedio, una célula viable durante el tramo seleccionado.

Forma continua

$$\frac{dP}{dt}=q_PX_v$$

Con datos discretos

$$q_P\approx\frac{P_2-P_1}{IVCD_{\Delta t}}$$

Rendimientos: biomasa/sustrato y producto/sustrato
!
En cultivos de células de mamífero, y especialmente en medios complejos, estos rendimientos deben leerse como rendimientos aparentes respecto al sustrato elegido. La glucosa no tiene por qué ser la única fuente de carbono o energía consumida en paralelo.

Los rendimientos relacionan el aumento de biomasa o de producto con el sustrato consumido. Son muy útiles para comparar condiciones, pero no siempre representan una estequiometría cerrada del metabolismo real.

Forma continua

$$Y_{X/S}=\frac{dX_v}{-dS},\qquad Y_{P/S}=\frac{dP}{-dS}$$

Con datos discretos

$$Y_{X/Glc}\approx\frac{X_{v,2}-X_{v,1}}{Glc_1-Glc_2},\qquad Y_{P/Glc}\approx\frac{P_2-P_1}{Glc_1-Glc_2}$$

Rendimiento aparente
Se obtiene cuando eliges un sustrato medido, por ejemplo glucosa, como único denominador de la relación.
Rendimiento real
Exigiría un balance más completo de entradas y salidas relevantes de carbono, energía y, en algunos casos, nitrógeno; por eso rara vez se cierra solo con glucosa en medios complejos de mamífero.

Resumen del flujo de cálculo

Paso 1
Medir

Obtener Xv, glucosa, lactato y producto en tiempos definidos.

Paso 2
Integrar

Calcular IVCD con suma trapezoidal sobre los datos disponibles.

Paso 3
Normalizar

Obtener r, q y rendimientos para el tramo de interés.

Paso 4
Interpretar

Comparar fases, condiciones o clones y revisar las limitaciones del modelo.

Sección 2 · Simulador

Simulador y exploración del comportamiento del cultivo

Esta sección usa un modelo simple para conectar los conceptos con un escenario dinámico. Está pensada para mover parámetros, observar tendencias y reforzar el significado biológico de $\mu$, IVCD, tasas específicas, tasas volumétricas y rendimientos.

Simulador

Esta sección no intenta ajustar un cultivo real. Su función es mostrar, de manera controlada, cómo cambian el crecimiento, el agotamiento de glucosa, la acumulación de producto y algunos parámetros derivados cuando se modifican ciertas hipótesis del sistema.

Cómo se calcula la simulación

$$\frac{dX_v}{dt}=\mu_{eff}X_v,\qquad \mu_{eff}=\mu_{max}\left(1-\frac{X_v}{X_{v,max}}\right)$$
$$\Delta Glc \approx \frac{\Delta X_v}{Y_{X/Glc}} + m_{Glc}\,IVCD_{\Delta t},\qquad \Delta P \approx q_P\,IVCD_{\Delta t}$$

El crecimiento se aproxima con una forma logística simple. El consumo de glucosa tiene dos componentes: uno asociado al aumento de biomasa y otro de mantenimiento. La formación de producto se calcula a partir de un qP constante. No se modelan cambios de viabilidad, cambios metabólicos de fase, consumo de múltiples sustratos, ni regulación fisiológica fina; esas omisiones son deliberadas para mantener la claridad didáctica.

Tiempo de duplicación
qGlc global aparente
Yp/Glc aparente
Glucosa residual final

Perfiles simulados

El comportamiento es intencionalmente simple y sirve para explorar tendencias, no para predecir un proceso real.

Tabla de resultados y variables primarias

Además de los parámetros derivados, esta tabla incluye las variables medidas al inicio y al final de cada tramo: Xv, glucosa, lactato y producto.

Intervalo Xv1 Xv2 Glc1 (mM) Glc2 (mM) Lac1 (mM) Lac2 (mM) P1 (mg/L) P2 (mg/L) Δt (d) μ (h⁻¹) IVCDΔ rGlc qGlc rLac qLac qP Yx/Glc Yp/Glc